Здесь лежат файлы реестра:
Add {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg - Добавление ветки (Сделана мной сразу после регистрации программы)
Remove {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg - Удаление ветки,

В ветке {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D} находится как сама регистрация,Видимо так и счетчик конвертаций, который после некоторого их числа проводит какую-то проверку, из-за которой и слетает регистрация.
Чтобы не искать ветку,потом удалять ее,опять регить вновь программу сделаны эти .reg файлы

То есть если слетела регистрация:
Запускаем Remove {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg ,он удалит ветку эту.где была регистрация
Запускаем Add {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg мы добавим тем самым эту ветку,где данные регистрации программы,программа вновь станет зарегистрированной
--------------------------------------
Кому не лень можно сделать запуск программы  скриптом: 
 
reg import Remove {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg 
reg import Add {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg 
vcloader.exe 
 
где: Remove {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg - удаление всей ветки {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D},  
       Add {C06F4056-C35F-4bf8-A93A-9F098F3E503D}.reg - добавление этой же ветки, полученной ее экспортом сразу после регистрации и выхода из программы. 
Проверено более, чем на 500 конвертациях - слетать перестала. Надо только после каждого пакета конвертаций (лучше делать чаще для надежности) выходить из программы и снова входить через скрипт, т.к. программа может слететь и в процессе работы, если счетчик конвертаций дойдет до предела.

P.S. к примеру на конвертации аудиодисков, где 20-40 треков. И через 2-3 диска регистрация может слететь,Т.е. это порядка 50-ти конвертаций